电子科技大学信息生物学研究中心采用格致大数据 Xiphias 生物信息计算平台辅助相关科研教学工作

在电子科技大学大力发展新兴战略学科的背景下,生命科学与技术学院等跨学院联合组建了信息医学研究中心、信息生物学研究中心,意在通过促进信息科学与生物医学的深度交叉,推动由计算与数据驱动的信息生物学研究范式的发展。

今年年初,随着格致大数据自主研发的 Xiphias 高性能生物信息计算平台完成 1.0 版本的开发,格致大数据与电子科技大学信息生物学研究中心达成了深化产学研合作的共识。 信息生物学研究中心采用了格致大数据高效的计算设备和服务助力中心的科研与教学工作,同时以研究中心的科研促进格致大数据相关产品、服务的优化升级。

Xiphias 高性能生物信息计算(一体机)

Xiphias 一体机是一款搭载格致大数据自主研发基因数据处理芯片的单节点生物信息数据处理平台。

相较于常规的高性能计算机而言,单节点的 Xiphias1.0 当前能够在 30 分钟内完成 30 倍深度人类全基因组数据的序列比对,在 2.5 个小时内完成 30X WGS 数据从 FASTQ 到 VCF 的全流程分析,实现较常规软件流程近 10 倍的数据处理加速比;而Xiphias2.0 将在 1.0 的基础之上实现更高的加速比,预计可达到 30~50 倍的数据处理加速比。

# 性能展示

Xiphias 高性能生物信息计算(集群)

Xiphias 集群是多节点的 Xiphias 生物信息数据处理平台,其数据处理效率较一体机又有成倍提升。

常规 5 节点的 Xiphias 集群可以在几分钟内完成 30 倍深度人类全基因组数据的序列比对,半小时左右完成从 FASTQ 到 VCF 的数据处理全流程,实现相较于常规生物信息数据处理软件几十倍的加速。

# 性能展示